Planta que parece ser la original.

En color rosa, partes actualmente desaparecidas. En amarillo, los cierres actuales. En blanco, la construcción actual.
 La planta original ha sufrido algunas reconstrucciones a lo largo de los años. La planta original presentaba una especie de crucero o transepto que se abría sobre una triple cabecera formada por tres capillas rectangulares no continuas. Esta estructura es de una gran originalidad y no tiene paralelo ni dentro ni fuera de España excepto en la basílica de Santa Lucía del Trampal (Cáceres) descubierta recientemente. Las dos capillas laterales debieron desaparecer al final de la Edad Media, siendo sustituidas, posiblemente hacia el siglo XV ó XVI, por otras dos adosadas a la central cubiertas por bóvedas ojivales. De esta manera, la planta quedó convertida en un simple rectángulo con la cabecera desfigurada.
Como se aprecia en el grabado de finales del siglo XIX, los muros de las naves laterales se habían perdido. Fueron reconstruidos pero no lo hicieron sobre los cimientos primitivos. Por eso no van paralelos a las columnas del interior.
Aspecto actual del muro oeste. Se observa a simple vista las partes que fueron cerradas en la Edad Media, con unas ventanas tipo saeteras. También se aprecian los contrafuertes góticos añadidos en esa época. Ver la imagen de abajo.
Arranque y comienzo de las bóvedas de las capillas laterales hoy perdidas. Arriba el lado sur; abajo el lado norte.
Actual bóveda gótica en lo que hoy es el ábside lateral izquierdo, y que en su origen estaba vacío.
Muro lateral reconstruido que no sigue la dirección de los cimientos.